MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Neorickettsia risticii str. Illinois

Total Repeats: 2415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013009	AC	3	6	779	784	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013009	AGC	2	6	3590	3595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013009	TA	3	6	3616	3621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013009	ACT	2	6	5951	5956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013009	CTT	2	6	6461	6466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013009	AAC	2	6	6484	6489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013009	CAC	2	6	6515	6520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_013009	TGC	3	9	7883	7891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013009	TATTT	2	10	7892	7901	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013009	CAGC	2	8	8180	8187	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013009	GCA	2	6	8198	8203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013009	AGT	2	6	8778	8783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013009	ACC	2	6	8813	8818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_013009	T	6	6	8838	8843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013009	GGC	2	6	8854	8859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013009	AGC	2	6	9584	9589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013009	GTCC	2	8	9653	9660	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013009	TCG	2	6	10064	10069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013009	GTT	2	6	10097	10102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013009	TGTAG	2	10	10121	10130	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013009	AG	3	6	10133	10138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013009	ATA	2	6	10153	10158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013009	T	6	6	10165	10170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013009	TAGT	2	8	10198	10205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013009	CT	4	8	10214	10221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013009	T	7	7	10412	10418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013009	TGT	2	6	12341	12346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013009	ACT	2	6	12420	12425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013009	TAT	2	6	12436	12441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013009	TAT	2	6	14341	14346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013009	CCA	2	6	14364	14369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_013009	TAT	2	6	14554	14559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013009	AAC	2	6	14658	14663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013009	A	6	6	14676	14681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013009	CCT	2	6	14682	14687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_013009	AGT	2	6	14744	14749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013009	GTA	2	6	14789	14794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013009	T	7	7	14941	14947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013009	AGTA	2	8	14995	15002	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013009	TCA	2	6	15051	15056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013009	CA	3	6	15055	15060	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013009	AC	3	6	15075	15080	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013009	CGCTG	2	10	15112	15121	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_013009	CT	3	6	15159	15164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013009	TTA	2	6	17087	17092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013009	T	6	6	17093	17098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013009	TGTT	2	8	17170	17177	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013009	TTG	2	6	17271	17276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013009	CTT	2	6	18069	18074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013009	TGG	2	6	18266	18271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013009	CGTG	2	8	18826	18833	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013009	CGTA	2	8	18848	18855	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013009	TTC	2	6	18884	18889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013009	GGGA	2	8	18917	18924	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013009	TTC	2	6	21322	21327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013009	CTG	2	6	21331	21336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013009	GAA	2	6	21366	21371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013009	AAG	2	6	22341	22346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013009	CAA	2	6	22354	22359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013009	ATA	2	6	22362	22367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013009	TA	3	6	22446	22451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013009	TTG	2	6	22543	22548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013009	AGA	2	6	22566	22571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013009	AAC	2	6	22623	22628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013009	GAA	2	6	22662	22667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013009	TCAT	2	8	23654	23661	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013009	CG	3	6	23712	23717	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013009	CGC	2	6	23779	23784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_013009	CGG	2	6	23872	23877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013009	TCCTC	2	10	23916	23925	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
71	NC_013009	ATC	2	6	23935	23940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013009	AGC	2	6	23946	23951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013009	AGC	2	6	23992	23997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013009	AGA	2	6	24002	24007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013009	AAG	2	6	24029	24034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013009	AGG	2	6	24119	24124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013009	GCT	2	6	25120	25125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013009	TGT	2	6	25129	25134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013009	GA	3	6	25138	25143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013009	TAA	2	6	26322	26327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013009	TTG	2	6	26367	26372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013009	GCTC	2	8	26387	26394	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_013009	AC	3	6	26947	26952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_013009	AC	3	6	26991	26996	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013009	CA	3	6	28303	28308	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013009	AAT	2	6	28312	28317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013009	AAG	2	6	28396	28401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013009	ATC	2	6	28439	28444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013009	AGTA	2	8	28459	28466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013009	TG	3	6	28486	28491	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013009	TAACA	2	10	29235	29244	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013009	A	6	6	29292	29297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013009	CAA	2	6	29374	29379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013009	TAA	2	6	29444	29449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013009	GGC	2	6	29466	29471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013009	TAA	2	6	29486	29491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013009	AT	3	6	29632	29637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013009	TAGTA	2	10	29679	29688	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013009	GAAA	2	8	29698	29705	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013009	T	6	6	30025	30030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013009	CTTT	2	8	30045	30052	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013009	AG	3	6	30135	30140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013009	GTTTA	2	10	31430	31439	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013009	TTTAAT	2	12	31471	31482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013009	TTA	2	6	31493	31498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013009	TAA	2	6	31527	31532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013009	TAT	2	6	34187	34192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013009	GT	3	6	34204	34209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013009	TTC	2	6	34345	34350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013009	TTA	2	6	34357	34362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013009	TGG	2	6	34420	34425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013009	ATCT	2	8	35245	35252	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_013009	GTA	2	6	36269	36274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013009	CT	3	6	36297	36302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_013009	AGC	2	6	36305	36310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013009	CGGT	2	8	36312	36319	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013009	AGTA	2	8	36337	36344	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013009	GAAC	2	8	36419	36426	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_013009	GCT	2	6	36469	36474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013009	GTA	2	6	36527	36532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013009	TGG	2	6	36626	36631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013009	CGA	2	6	36650	36655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013009	GAT	2	6	36675	36680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013009	GCA	2	6	36724	36729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013009	TGA	2	6	36782	36787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013009	AGA	2	6	36841	36846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013009	CAG	2	6	36867	36872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013009	GTT	2	6	36898	36903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013009	GA	3	6	37008	37013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013009	AGGG	2	8	37360	37367	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013009	GTC	2	6	37407	37412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013009	TCGTG	2	10	37416	37425	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_013009	GGA	2	6	37520	37525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013009	GAC	2	6	37533	37538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013009	TCA	2	6	37545	37550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013009	TATGG	2	10	37558	37567	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013009	AC	3	6	37571	37576	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013009	TAC	2	6	37578	37583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013009	AGCT	2	8	37600	37607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_013009	TGC	2	6	37711	37716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_013009	AC	3	6	37741	37746	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_013009	AGG	2	6	37800	37805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013009	GGTGG	2	10	37817	37826	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013009	GTTG	2	8	38348	38355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013009	TAT	2	6	38387	38392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013009	ATTA	2	8	38499	38506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013009	TCTA	2	8	40455	40462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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438	NC_013009	GGT	2	6	101898	101903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_013009	TTG	2	6	104298	104303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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